Occurrence dataset Registered November 09, 2022
Biobanco de parasitología de Chagas (Sangre) del Instituto Nacional de Salud
Description
La enfermedad de Chagas es una enfermedad parasitaria zoonótica causada por el protozoario Trypanosoma cruzi. Se considera un problema de salud pública en América Latina, donde actualmente hay aproximadamente 6 millones de personas infectadas. La fase aguda de la enfermedad se caracteriza por fiebre generalmente leve que en una pequeña proporción de casos puede acompañarse de miocarditis y otras complicaciones letales. La mayoría de los pacientes continúan a través de la fase crónica que se caracteriza inicialmente por un curso clínico asintomático durante dos o tres décadas, y alrededor del 30% de los pacientes infectados desarrollarán complicaciones cardíacas o digestivas posteriormente.
El presente proyecto tuvo el objetivo de realizar la caracterización de una cohorte de pacientes con enfermedad de Chagas, su tratamiento etiológico, eventos adversos y respuesta terapéutica y sus objetivos específicos fue caracterizar la respuesta al tratamiento etiológico medida por desenlaces clínicos (ecocardiograma), serológicos (IgG anti-T.cruzi) y parasitológicos por PCR, que hicieron necesario tanto las muestras de suero (exámenes serológicos como las muestras de sangre total para la identificación del parásito por pruebas moleculares como la PCR. Tanto en pacientes en fase aguda como crónica.
El presente recurso cuenta con 774 registros biológicos, de la especie Trypanosoma cruzi. Estos registros se obtuvieron de muestras de sangre de pacientes con enfermedad de Chagas entre el año 2013 al 2015.
Geographic scope
- Description
Las muestras recolectadas se procesaron y analizaron en el Instituto Nacional de Salud, sede Teusaquillo, Avenida calle 26 No. 51-20
- Bounding box
- Latitude
- From 4.642 to 4.642
- Longitude
- From -74.095 to -74.095
Temporal scope
- range
- January 11, 2013 - December 10, 2015
Taxonomic scope
- Description
Este conjunto de datos comprende 774 registros biológicos. Se encuentran distribuidos en el reino Protozoa, filo Euglenozoa, clase Kinetoplastea, orden Trypanosomatida, familia Trypanosomatidae. El 100% está clasificado a nivel de especie.
- Coverage
- Trypanosoma cruzi
Methodology
- Sampling
Se consideraron potenciales participantes todos los pacientes que acudieron al Instituto Nacional de Salud de Colombia (Total 985 personas) en busca de pruebas diagnósticas para la enfermedad de Chagas en fase aguda (113 pacientes) o crónica (872 pacientes) entre 2004 y 2015. Los criterios de inclusión fueron: i. Sospecha clínica o epidemiológica de enfermedad de Chagas en fase aguda o crónica ii. No haber recibido tratamiento etiológico para la enfermedad de Chagas iii. Pruebas serológicas positivas para la enfermedad de Chagas (IFA, ELISA y/o HAI) iv. Disponibilidad de muestras de sangre y suero adecuadas para la realización de pruebas diagnósticas según la fase clínica. v. Aceptación para participar y firma del consentimiento informado.
- Study extent
Instituto Nacional de Salud de Colombia
- Method steps
Clasificación clínica. Fase aguda: Se definió como caso sospechoso a un individuo con > 7 días de fiebre acompañada o no de hepatomegalia o esplenomegalia. El paciente fue considerado con enfermedad de Chagas aguda si además de los síntomas daba positivo por pruebas parasitológicas (Strout, micro-strout, gota gruesa de sangre o hemocultivo) o presentaba resultados positivos a dos pruebas serológicas en el transcurso de las siguientes semanas. Los pacientes fueron clasificados como negativos a la enfermedad de Chagas por lo demás señalado.
Fase crónica: Individuos sin criterios de fase aguda pero con sospecha clínica o epidemiológica de enfermedad de Chagas. Los pacientes fueron confirmados como positivos T.cruzi, al dar positivo en dos pruebas serológicas (IFA, ELISA y/o HAI). Luego se clasificó como crónica indeterminada (cuando no se evidenciaron signos o síntomas de complicaciones cardíacas) o crónica determinada de otra manera.
Pruebas de laboratorio. Métodos parasitológicos. Los métodos parasitológicos directos se realizaron (Strout, micro-strout, gota gruesa de sangre o hemocultivo) de acuerdo con la metodología descrita por Freilij et al., 1983. Los resultados se consideraron positivos cuando la morfología compatible con la T . cruzi fue observado. Todas las muestras fueron analizadas sin conocimiento del estado clínico u otra prueba.
Pruebas serológicas: El ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA), el ensayo de anticuerpos de inmunofluorescencia (IFA) o el ensayo de inhibición de la hemaglutinación (HAI) se estandarizaron originalmente en el Instituto Nacional de Salud con T.cruzi cepas pertenecientes a TcI. Todas las pruebas serológicas se realizaron por duplicado y se utilizaron controles positivos y negativos para cada ensayo. La prueba ELISA se consideró positiva cuando la absorbancia fue ≥0,300, IFA cuando los títulos fueron ≥1/32 y HAI cuando los títulos fueron ≥1/32.). Todas las muestras fueron analizadas sin conocimiento del estado clínico u otras pruebas. Los resultados indeterminados en las pruebas de serología (ELISA e IFI) se resolvieron mediante el uso de la prueba HAI.
Pruebas de diagnóstico molecular. Se recolectaron 10 ml de muestras de sangre y se almacenaron con un volumen igual de clorhidrato de guanidina 6M, tampón EDTA 0,2 M, pH 8,00 (GEB) y posteriormente se almacenaron a 8 °C. Se congelaron 5 ml de suero a -70 °C. Se emplearon alícuotas de 300 microlitros de GEB y se añadieron 5 microlitros de plásmido IAC (40 pg/microlitros) como control interno. Las muestras se sometieron a extracción de ADN utilizando el kit High Pure PCR Template Roche según Duffy et al., 2013. PCR convencional (cPCR) y PCR cuantitativa multiplex (qPCR) para la detección de ADN satélite de T.cruzi y el ADN del plásmido IAC. La prueba qPCR se consideró positiva cuando la amplificación superó el umbral de fluorescencia 0,01 y cPCR cuando se observó un fragmento de ADN de 166 pb en la electroforesis. Las muestras positivas para PCR nuclear satelital (qPCR y cPCR), fueron confirmadas por kPCR. Las cargas parasitarias por qPCR se midieron como equivalentes de parásitos por ml según Moreira et al., 2013, utilizando una cepa TcI como curva estándar (MHOM/CO/01/DA]. Todas las muestras se analizaron sin conocimiento del estado clínico u otras pruebas.
Discriminación de DTU. La PCR se realizó utilizando cinco marcadores moleculares diferentes destinados a detectar las seis DTU y las dos subdivisiones de TcI descritas previamente por otros autores (TcIDom y TcI sylvatic).
Metrics
Contacts
- Organization
- Instituto Nacional de Salud
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- Investigadora principal/Curadora
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- Avenida calle 26 No. 51-20
- Roles
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- Instituto Nacional de Salud
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- Investigadora/Curadora
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- Avenida calle 26 No. 51-20
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- Instituto Nacional de Salud
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- Avenida calle 26 No. 51-20
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Metadata author
Administrative point of contact - Phone
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- Instituto Nacional de Salud
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- Avenida calle 26 No. 51-20
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Metadata author
- Organization
- Instituto Nacional de Salud
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- Investigadora
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- Avenida calle 26 No. 51-20
- Roles
- Originator
GBIF registration
- Registration date
- November 09, 2022
- Metadata last modified
- June 22, 2023
- Publication date
- December 12, 2022
- Hosted by
- Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia - SiB
- Installation
- Datos sobre Biodiversidad de Colombia
- Endpoints
- Darwin Core Archive
- EML
- Preferred identifier
- 10.15472/dg2pok
- Alternative identifiers